自治州有色金属矿以铜、铅、锌为主，储量大，品位高，并已投入生产，形成了采掘、选矿和冶炼。稀有金属金、银、镍、钴、铍、锂、钽、铌、锶等有一定储量。

一、铜矿

全州共有铜矿60余处，已探明上万吨的矿床14个。主要分布在木吉—苏巴什—布伦口一线，以盖孜河和克孜勒河流域较多。以成因类型分主要为：热液型铜矿、矽卡岩型铜矿、沉积岩型铜矿、层控铜矿床等。

卡勒玛铜矿

位于阿克陶县布伦口乡西部，故又称布伦口铜矿，距中巴公路约18千米，有简易公路可以通车，交通方便。矿体呈脉状、透镜状分布，主要由卡勒玛、东大沟、西山头3个矿段和4个矿点组成，其中卡勒玛矿段为主要矿段，由5个矿体组成。1973年底矿石保有67.4万吨，含铜金属21 309吨。

沙子沟铜矿

位于阿克陶县布伦口乡西25千米处，直线距卡勒玛铜矿西北35千米，有简易公路。矿体结构简单，基本上有2个矿体，矿石总含量9.36万吨。

特格里曼苏铜矿

位于阿克陶县布伦口乡，盖孜河支流特格里曼苏河上游，距阿图什市163千米，距卡勒玛铜矿直线距离55千米。矿化带在矿区范围之内长达5.4千米，宽400米，共有4个含矿层，伴生有银，含量较高，可供综合利用。储量测算有C1级铜金属量1 833.3吨，C2级铜金属8 764.4吨，表层C2级铜金属1 250.1吨。矿层中普遍含银10～30克／吨，部分可达100克／吨，并含有钼0.001％，镓0.001％。

阿尔巴列克铜矿

在阿克陶县克孜勒塔克乡，从喀什至和田公路143千米界牌处，向南行60千米简易公路可直达矿区。距布伦口铜矿150千米。属中温热岩矿床，产于泥盆纪和石炭纪地层，铅矿体长300米，厚2～15米，垂深100米，铜矿体长250米，厚1～22米，垂深100米。矿石以黄铜矿、方铅矿为主，多为氧化矿石，地表氧化强烈。1962年十大正规赌钱官方首页储委会批准矿区C1级铜的金属量8 874吨，C2级铜金属量1 048吨；铅金属表处C2储量8 428吨。

莎哈尔铜矿

位于乌恰县城西南32千米处，矿床成因类型为沉积型含铜砂岩矿床，矿带总长度5～6千米，层位比较稳定，但厚度变化大。主要矿石矿物为赤铜矿、辉铜矿、孔雀石和少量自然铜。平均品位较高，金属铜储量约为880.36吨。

沙里拜铜矿

位于乌恰县城西北，距县城60千米，属沉积型含铜矿床。铜金属储量180吨。

沙洛依铜矿

位于乌恰县，为黄铁矿型的黄铜矿。矿物主要为黄铜矿，含量为5％，其次为黄铁矿，含量约1％。

通古孜阿合孜铜矿

位于阿图什市格达良乡八盘水磨以东约25千米，312国道北侧沿山沟入山约5千米即矿点。为含铜砂岩矿化带，长1 000米，厚两米，在离地面2～3米的山体中，共分两层，东北—西南走向。主要为孔雀石、赤铜矿，自然铜品位仅在1％以下，金属铜含量约350吨。矿层稳定，近公路。清同治年间曾经开采，至今前人开过的遗迹还历历在目。当时所采矿石运至东南方向20千米处就地冶炼，矿渣犹在。后由于矿工不堪压迫而起义，被清政府明令停采。

哈拉峻铜矿

位于阿图什市哈拉峻乡，距阿图什约100千米。为矽卡岩型矿床，产于石炭二迭纪的矽卡岩地层。有4层矿化层，层位稳定，长约2 000～4 000米，厚1.5米，矿化不均，多为贫矿，其中较好一段长170米，厚1.5米。平均品位：铜0.58％，锌0.19％。矿石矿物主要为黄铜矿和闪锌矿，仅就此段计算铜金属含量为610吨，锌金属199.3吨。

二、铅锌矿

自治州铅锌矿储量多，品位高，开采早，已形成工业规模和效益。其中中型矿床有3个，为霍什布拉克、塔木、卡兰古，小型矿床4个。这6个矿区和矿点共探明储量铅金属39.44万吨，锌金属36.05万吨。

霍什布拉克铅锌矿

位于阿图什市哈拉峻乡霍什布拉克以北，属热液型矿床，产于泥盆纪灰岩中。矿区构造不复杂，矿体呈层状产出。主要铅矿物有白铅矿、菱锌矿、闪锌矿，并伴生镉、银、钴等，银含量平均12.15克／吨。平均品位铅3.69％，锌7.16％。铅金属储量82 135.4吨，锌金属储量171 622.6吨，镉金属储量1 059吨，钴金属含量106吨。

塔木铅锌矿

位于阿克陶县克孜勒陶乡塔木村5千米处，有简易公路可达矿区，交通方便。此处属岩型矿床，产于下石炭纪的白云岩化灰岩中，矿化带长800米，最宽40米。金属矿物为闪锌矿、方铅矿、黄铁矿；脉石矿物为白云石、方解石、石英、云母、石膏。矿石品位，由于矿化度不匀，贫矿与富矿交替出现。矿石含量计算为310.6万吨，含金属锌13.43万吨，铅4.12万吨。

卡兰古托克拉克铅锌矿

位于阿克陶县库斯拉甫乡东的阿尔塔什西北6千米处，有简易公路，交通方便。矿区属热型矿床，产于泥盆纪的白云岩化灰岩中，岩层多褶皱，断裂构造复杂。有大小矿体10多条，矿体中主要金属矿物为方铅矿，其次为黄铁矿、黄铜矿、闪锌矿以及微量砷镍矿。次生矿为孔雀石、铜兰、兰铜矿、辉铜矿、白铅矿等。铅矿石储量695.9万吨，含铅金属19.24万吨，银金属储量55.44吨，钴金属储量1 468.95吨，镓金属储量73.95万吨。矿区附近有乌苏里克矿点，属热液充填交替型矿床。矿体产于下盘白云岩灰岩中，矿化带长约800米，共有大小矿体7条。主要金属矿物为方铅矿、闪锌矿、黄铜矿等。脉石矿物为方解石、白云石、石英。C2级含量5万吨，其中含铅金属3 000吨，锌金属4 600吨，属小型矿。